Home - Новости - Структура оболочки ВИЧ раскололась при помощи суперкомпьютера

Структура оболочки ВИЧ раскололась при помощи суперкомпьютера

images

Новое исследование, опубликованное 13 июня 2013 года, описывает, как специалисты в США впервые взломали химическую структуру капсулы вируса или оболочку белка вируса иммунодефицита человека (ВИЧ). Прогресс, который вероятно открывает путь к изобретению сильных лекарств против вируса, вызывающего СПИД, был достигнут с помощью нового «petascale» суперкомпьютера.

Ученые пытались в течение некоторого времени взломать точную химическую структуру капсулы вируса ВИЧ (с формой конуса), оболочку белка, которая защищает генетический материал вируса. Капсула вируса, как думают ученые, является ключом к ядовитости ВИЧ. Теперь она стала привлекательной целью для нового антиретровирального развития препарата.

Как старший автор этого исследования, Пейджин Занг, адъюнкт — профессор структурной биологии в Университете Питсбургской Школы Медицины, заявил в своем докладе:

«Капсула вируса критически важна для лечения ВИЧ, таким образом, зная, что понимание его структуры сможет привести нас к новым лекарствам, которым будет под силу лечить или предотвращать инфекционные заболевания».

«У этого подхода есть потенциал, чтобы быть сильной альтернативой нашим текущим методам лечения ВИЧ, которые работают, предназначаясь для определенных ферментов, но сопротивление препарата — огромный вызов из-за высокой нормы мутации вируса».

Моделирование, которое добавило недостающие части к загадке об оболочке вируса ВИЧ, проводились во время открытого тестирования, cо-авторами Клаусом Шультеном, профессором физики, и Жуаном Периллой, исследователем из Университета Иллинойса.

После дальнейших экспериментов они выявили, что определенные области белков взаимодействуют друг с другом в цепи, которая «важна для собрания капсулы вируса и стабильности, и для вирусной инфекционности», — отмечают ученые.

Благодаря этим методам исследователи обнаружили, что раковина белка ВИЧ включает 216 шестиугольников и 12 пятиугольников, устроенных в цепи. Белки в шестиугольниках и пятиугольниках были идентичны, но углы, через которые они были свойственны друг другу, были различны среди разных областей структуры.